Le Secrétariat général entreprend les tâches suivantes :
1. Assurer la gestion du cheminement professionnel des employés universitaires dans le respect des pouvoirs du collège et de l'institut en ce domaine.
2. Préparer le projet de budget de l’université et suivre son exécution.
3. Assurer le suivi financier des activités des laboratoires et des unités de recherche.
4. Veiller à la bonne conduite des intérêts communs de l'université.
5. Établir et promouvoir les activités culturelles et sportives de l’université.
6. Assurer le suivi et la coordination des plans de sécurité intérieure de l’université en coordination avec le Bureau ministériel de la sécurité intérieure.
7. Assurer la gestion et la préservation des archives et de la documentation de la Direction de l'Université.
8. Assurer l'organisation et la gestion du bureau universitaire.
Le Secrétariat Général, auquel sont rattachés le Bureau de l'Organisation Générale et le Bureau de la Sécurité Intérieure, comprend les sous-répertoires suivants :
1. Sous-Direction des Utilisateurs et de la Formation.
2. Sous-direction des finances et de la comptabilité.
3. Sous-Direction des Moyens et de l'Entretien.
4. Sous-direction des activités scientifiques, culturelles et sportives.