تتكفل المديرية الفرعية للمالية والمحاسبة بما يأتي :

1- تحضير مشروع ميزانية الجامعة على اساس اقتراحات عمداء الكليات ومديري المعاهد والملحقات.

2- متابعة تنفيذ ميزانية الجامعة.

3- تحضير تفويض الاعتمادات الى عمداء الكليات ومديري المعاهد والملحقات وضمان مراقبة تنفيذها.

4- متابعة تمويل انشطة البحث التي تضمنها المخابر والوحدات.

5- تحسين محاسبة الجامعة.