لقد استفادت جامعة الوادي بخمسة (05) مخابر مخصصة لمعهد العلوم والتكنولوجيا هي :
مخــابرالفيزياء:
* مخبر الميكانيك
* مخبر الكهرباء والمغناطيسية
* مخبر البصريات
* مخبر الترموديناميك
* مخبر الفيزياء الذرية
* مخبر الفيزياء النووية
* مخبر الاهتزازات والامواج
* مخبر فيزياء الجسم الصلب
مخــابرالكيمياء:
* مخبر التحليل والقياس
* وسائل المخبر
مخــابر هندسة الطرائق:
* مخبر التحويلات
* مخبر الحركة والترموديناميك
* مخبر الهندسة الكيميائية